RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CLPTM1	O96005	669 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	APRT	P07741	180 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RGS2	P41220	211 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	NDUFS3	O75489	264 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RALA	P11233	206 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PDE8B	O95263	885 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC16A1	P53985	500 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	BTG4	Q9NY30	223 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	TM9SF1	O15321	606 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	TGFBR2	P37173	567 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	FNTA	P49354	379 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CENPA	P49450	140 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ATP10B	O94823	1461 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CCT8	P50990	548 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CENPC	Q03188	943 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	NME3	Q13232	169 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ACCSL	Q4AC99	568 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	TASP1	Q9H6P5	420 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	HMG20A	Q9NP66	347 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CDK17	Q00537	523 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RCN1	Q15293	331 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SLC18A3	Q16572	532 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18	2e-7	■■□□□ 13.3
NCOR2-208	ENST00000429285	BNC1	Q01954	994 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	LINC00523	Q86TU6	105 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CENPT	Q96BT3	561 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KLHL3	Q9UH77	587 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ESYT3	A0FGR9	886 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285		B2RBV5	119 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MED26	O95402	600 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	POLB	P06746	335 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	TPI1	P60174	286 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	TUBA4A	P68366	448 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CCNJL	Q8IV13	435 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SCNN1D	P51172	638 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	KATNA1	O75449	491 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CHRND	Q07001	517 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	CNTN1	Q12860	1018 aa		13.91	□□□□□ -0.18
NCOR2-208	ENST00000429285	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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