RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 LRRN2O75325 713 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 OR4Q2P0C623 313 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 GAP43P17677 238 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 RPS9P46781 194 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ACOT2P49753 483 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 CENPPQ6IPU0 288 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TPRG1Q6ZUI0 275 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TMC8Q8IU68 726 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ADSSL1Q8N142 457 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 FAM212AQ96EL1 285 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 PGLYRP2Q96PD5 576 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 DSEQ9UL01 958 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ASB3Q9Y575 518 aa22.73■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TISP43B9A030 160 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 NCAM2O15394 837 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 MYL4P12829 197 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 PSMC3P17980 439 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 EPHB3P54753 998 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP4Q13115 394 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 POSTNQ15063 836 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 VITQ6UXI7 678 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SV2BQ7L1I2 683 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 DYMQ7RTS9 669 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 IRF7Q92985 503 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 E2F7Q96AV8 911 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.72■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SHISA7A6NL88 538 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ADSSP30520 456 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH1A3P47895 512 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 CLIC6Q96NY7 704 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 BRD9Q9H8M2 597 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.71■■□□□ 1.23
LIMS1-208ENST00000428064 FAM186AA6NE01 2351 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MYMKA6NI61 221 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MAN2B1O00754 1011 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 IL18RAPO95256 599 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 FGF19O95750 216 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 CD72P21854 359 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 TAF6P49848 677 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ALCAMQ13740 583 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 GRM2Q14416 872 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 TEAD2Q15562 447 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 OR10T2Q8NGX3 314 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 PSMG2Q969U7 264 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 R4GN57 208 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 SCN1AP35498 2009 aa22.7■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 LAMTOR5O43504 91 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCB1Q12824 385 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 SLC39A14Q15043 492 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ITIH5Q86UX2 942 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ACCSQ96QU6 501 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM209Q96SK2 561 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 IER2Q9BTL4 223 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 DPP3Q9NY33 737 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR6Q9Y217 621 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 DCHS1Q96JQ0 3298 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 TCHHQ07283 1943 aa22.69■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRU2 124 aa22.68■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 GJA1P17302 382 aa22.68■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
LIMS1-208ENST00000428064 FZD5Q13467 585 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms