RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 EPHA5P54756 1037 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 SPEM2Q0P670 501 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF687Q8N1G0 1237 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 MYCT1Q8N699 235 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ATAD1Q8NBU5 361 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 E2F7Q96AV8 911 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM209Q96SK2 561 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.99■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 FAM13AO94988 1023 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ODC1P11926 461 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CYP3A5P20815 502 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 NCKAP1LP55160 1127 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP8P85298 464 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 GPR17Q13304 367 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC32Q14392 662 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 HYIQ5T013 277 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 GPBP1Q86WP2 473 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TMC8Q8IU68 726 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 BEST2Q8NFU1 509 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 KCND2Q9NZV8 630 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 MTMR11A4FU01 709 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CHRNB1P11230 501 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TDGF1P13385 188 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 GABRR2P28476 465 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 FNTBP49356 437 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 KYAT1Q16773 422 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 GPR158Q5T848 1215 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 JADE1Q6IE81 842 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 SENP8Q96LD8 212 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 REEP2Q9BRK0 252 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 IER2Q9BTL4 223 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TBX20Q9UMR3 447 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CEP250Q9BV73 2442 aa20.97■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 OGTO15294 1046 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CHADO15335 359 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CYP4F8P98187 520 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 DMWDQ09019 674 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TAF12Q16514 161 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 SLC39A12Q504Y0 691 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ARSHQ5FYA8 562 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CENPPQ6IPU0 288 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 Q6ZS52 159 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 CALML4Q96GE6 196 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 GCNAQ96QF7 691 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 LPIN3Q9BQK8 851 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 LRRC3Q9BY71 257 aa20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
UBXN4-202ENST00000415164 ARNTLO00327 626 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 NFICP08651 508 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 TYMPP19971 482 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 KCNA4P22459 653 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 MYBPC2Q14324 1141 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 GAS6Q14393 721 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 VEPH1Q14D04 833 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB6Q15916 424 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 ITIH5Q86UX2 942 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 KIF2CQ99661 725 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 UBA7P41226 1012 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 LILRA4P59901 499 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 MCM6Q14566 821 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM132DQ14C87 1099 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 PON2Q15165 354 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 SPATA1Q5VX52 437 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 GAREM2Q75VX8 874 aa20.94■□□□□ 0.94
UBXN4-202ENST00000415164 METTL23Q86XA0 190 aa20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms