RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373439.6

RALGPS1-205, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 5

Gene RALGPS1, Length 1,527 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-205ENST00000373439 MYL5Q02045 173 aa21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 HYAL1Q12794 435 aa21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 DUSP6Q16828 381 aa21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 PPP2R3CQ969Q6 453 aa21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 TLE6Q9H808 572 aa21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.5■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 PMM2O15305 246 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 LRRN2O75325 713 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 PIK3CAP42336 1068 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 NRIP1P48552 1158 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 FMO5P49326 533 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CREMQ03060 361 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 KCNH2Q12809 1159 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CDKAL1Q5VV42 579 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 SEMA4DQ92854 862 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CLSTN3Q9BQT9 956 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 DSEQ9UL01 958 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 L1RE1Q9UN81 338 aa21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 KCNC3Q14003 757 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 COL19A1Q14993 1142 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ZNF699Q32M78 642 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 WSCD1Q658N2 575 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 TOP6BLQ8N6T0 577 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 TAF4BQ92750 862 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 FANCLQ9NW38 375 aa21.48■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ADAM12O43184 909 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 HUS1O60921 280 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 NDUFV1P49821 464 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ZNF165P49910 485 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 DPH6Q7L8W6 267 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 RAB20Q9NX57 234 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.47■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 KCNJ18B7U540 433 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 H7C4K7 107 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 P4HA2O15460 535 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ADH1AP07327 375 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 KCNJ12Q14500 433 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ZNF280DQ6N043 979 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 EFHBQ8N7U6 833 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 CDY1Q9Y6F8 540 aa21.46■■□□□ 1.03
RALGPS1-205ENST00000373439 ZNF18P17022 549 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 KLRC2P26717 231 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 CLCN4P51793 760 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 MYL7Q01449 175 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 IQCB1Q15051 598 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 MAN2A1Q16706 1144 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 SPATA18Q8TC71 538 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 SLC22A17Q8WUG5 538 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 IGFLR1Q9H665 355 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 POLIQ9UNA4 740 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 GABRDO14764 452 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 OR1D2P34982 312 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 TNNC1P63316 161 aa21.45■■□□□ 1.02
RALGPS1-205ENST00000373439 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms