RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC62Q6P9F0 684 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 ACOT1Q86TX2 421 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 SPC24Q8NBT2 197 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC9Q8NEP7 349 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-201ENST00000348564 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-201ENST00000348564 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.653e-7■■■□□ 16.6
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PRU2 124 aa4.72□□□□□ -1.65
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