RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 CGRRF1Q99675 332 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 COL4A5P29400 1685 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TMED2Q15363 201 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 MTFR1Q15390 333 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 MAML1Q92585 1016 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 KLHL29Q96CT2 875 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.75■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 STAM2O75886 525 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 MMP8P22894 467 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 NAMPTP43490 491 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ADCY1Q08828 1119 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 PORCNQ9H237 461 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 DNPEPQ9ULA0 475 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A1B0GUA9 196 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT10P13645 584 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 OAZ1P54368 228 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNJ2P63252 427 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 MCL1Q07820 350 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC38Q5VT99 294 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF43Q68DV7 783 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 FITM2Q8N6M3 262 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.74■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 KRT1P04264 644 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 CALB1P05937 261 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TAC1P20366 129 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 BACE1P56817 501 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ACVR2BQ13705 512 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ARSEP51690 589 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 NCOA4Q13772 614 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TDRPQ86YL5 185 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ALLCQ8N6M5 410 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 A0A0B4J269 797 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 NDC80O14777 642 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 GLRA2P23416 452 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 TRABD2AQ86V40 505 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.72■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 GPS1Q13098 491 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 REPS2Q8NFH8 660 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF302Q9NR11 478 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXO40Q9UH90 709 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 FOXN2P32314 431 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 MORF4L2Q15014 288 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 CGB2Q6NT52 195 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 SENP1Q9P0U3 644 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.71■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.7■■□□□ 1.23
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP2A1O14983 1001 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 OATP04181 439 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 ARL2P36404 184 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC18A1P54219 525 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.7■■□□□ 1.22
PTDSS1-201ENST00000337004 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms