RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335071.3

FOXE3-201, Transcript of forkhead box E3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXE3, Length 1,981 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3-201ENST00000335071 SNX17Q15036 470 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 KLHL7Q8IXQ5 586 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 KIF12Q96FN5 646 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 HPDLQ96IR7 371 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 AGAP1Q9UPQ3 857 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SCINQ9Y6U3 715 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 CITO14578 2027 aa27.87■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 PAEPP09466 180 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 IFT20Q8IY31 132 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 TMEM35BQ8NCS4 154 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 TRIB2Q92519 343 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 UBXN6Q9BZV1 441 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SNTG2Q9NY99 539 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 GABRQQ9UN88 632 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 MMP8P22894 467 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SLC1A1P43005 524 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 YARSP54577 528 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 MYADML2A6NDP7 307 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 MYO1FO00160 1098 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 RAP1GAPP47736 663 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 FLT3LGP49771 235 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 CYP4F22Q6NT55 531 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 TFAP2BQ92481 460 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SNX27Q96L92 541 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SDCBP2Q9H190 292 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 GDF3Q9NR23 364 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 CEP83Q9Y592 693 aa27.85■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 RAD51CO43502 376 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 MED7O43513 233 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 CALB1P05937 261 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 GLI1P08151 1106 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 MARCKSL1P49006 195 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 C2CD6Q53TS8 623 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 GNASQ5JWF2 1037 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SMYD3Q9H7B4 428 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 ITGA4P13612 1032 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 GUCY2FP51841 1108 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 CDH8P55286 799 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 MAMLD1Q13495 774 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 PPP2R5EQ16537 467 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SEL1L2Q5TEA6 688 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 TAF2Q6P1X5 1199 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 TMEM40Q8WWA1 233 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SPC25Q9HBM1 224 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 PARVAQ9NVD7 372 aa27.84■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 KIF3CO14782 793 aa27.83■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 SART1O43290 800 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 RAD23BP54727 409 aa27.83■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
FOXE3-201ENST00000335071 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 CILPO75339 1184 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 HSPA6P17066 643 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 RWDD2BP57060 319 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 LLGL2Q6P1M3 1020 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 CPNE8Q86YQ8 564 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 TTC39CQ8N584 583 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 TRIP11Q15643 1979 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 CD19P15391 556 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 GUCY2DQ02846 1103 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 NOGQ13253 232 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 WHAMMQ8TF30 809 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 TRIM7Q9C029 511 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 LHX5Q9H2C1 402 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 EPB41L5Q9HCM4 733 aa27.82■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 PROSCO94903 275 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 NKX3-2P78367 333 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 MYO1EQ12965 1108 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 CCDC26Q8TAB7 109 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 ST7Q9NRC1 585 aa27.81■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 SEPT4O43236 478 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 PRKCZQ05513 592 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 ZBTB6Q15916 424 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 ALKAL1Q6UXT8 129 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 WDTC1Q8N5D0 677 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 SLC4A11Q8NBS3 891 aa27.8■■■□□ 2.04
FOXE3-201ENST00000335071 FEZF2Q8TBJ5 459 aa27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms