RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 RMDN1Q96DB5 314 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 MTMR9Q96QG7 549 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 GPR182O15218 404 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.167e-7■■□□□ 12.7
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LRP5-201ENST00000294304 RAD51Q06609 339 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 CNTN2Q02246 1040 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.31■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 KCNJ1P48048 391 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 LRRC14Q15048 493 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 SV2AQ7L0J3 742 aa22.31■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.31■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 SNX2O60749 519 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 INSRRP14616 1297 aa22.3■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.3■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 CCNYL1Q8N7R7 359 aa22.3■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.3■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 ZNF286BP0CG31 522 aa22.3■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.3■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.29■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 SENP1Q9P0U3 644 aa22.29■■□□□ 1.16
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LRP5-201ENST00000294304 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 ODC1P11926 461 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 USP33Q8TEY7 942 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 PAK5Q9P286 719 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 AP3B1O00203 1094 aa22.28■■□□□ 1.16
LRP5-201ENST00000294304 ACOT1Q86TX2 421 aa22.28■■□□□ 1.16
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