RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MYL2P10916 166 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 HMOX2P30519 316 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MTSS1O43312 755 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC134Q9H6E4 229 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TASP1Q9H6P5 420 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MOSPD1Q9UJG1 213 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CDY2AQ9Y6F7 541 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.13■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TLR2O60603 784 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ERVK-24P63145 666 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MAPK7Q13164 816 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CYTH1Q15438 398 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 B2RBV5 119 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PYGLP06737 847 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GPD1P21695 349 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PPP4CP60510 307 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB10P48595 397 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 THTPAQ9BU02 230 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf96A6NNT2 1141 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ACAD10Q6JQN1 1059 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC9Q8WXX5 260 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 E2F7Q96AV8 911 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CORO7P57737 925 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 EME1Q96AY2 570 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 H0Y626 953 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM16O95361 564 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GRIK1P39086 918 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ACCSLQ4AC99 568 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 IER5Q5VY09 327 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0G2JLW4 131 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 DPYSL4O14531 572 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CYP11B2P19099 503 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 FUT8Q9BYC5 575 aa22.11■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 A0A087X0T9 212 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 FAM228BP0C875 321 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PDIA6Q15084 440 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GTF2H1P32780 548 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 BOLA3Q53S33 107 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 THAP11Q96EK4 314 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 KCNA4P22459 653 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 RRM2BQ7LG56 351 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 NSL1Q96IY1 281 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SUPT3HO75486 399 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 APOA1P02647 267 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GRB10Q13322 594 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PNKPQ96T60 521 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.1■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PSTPIP1O43586 416 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 THAP2Q9H0W7 228 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 BLOC1S6Q9UL45 172 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 CDYLQ9Y232 598 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 GH1P01241 217 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 HIST1H2ADP20671 130 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 MUTP22033 750 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 NPEPPSP55786 919 aa22.09■■□□□ 1.13
CCSAP-201ENST00000284617 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms