RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000235347.4

PRAMEF10-201, Transcript of PRAME family member 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF10, Length 1,525 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10-201ENST00000235347 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PRAMEF10-201ENST00000235347 I3L4J1 428 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 PIRO00625 290 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TADA2AO75478 443 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 KRT19P08727 400 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 MARSP56192 900 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 KRT17Q04695 432 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 UBE3AQ05086 875 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 PPP3CAQ08209 521 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ELF2Q15723 593 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TCERG1LQ5VWI1 586 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 USP37Q86T82 979 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 SLC35C1Q96A29 364 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 WDR24Q96S15 920 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 DESI2Q9BSY9 194 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZBP1Q9H171 429 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TLR9Q9NR96 1032 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 MYO9BQ13459 2157 aa9.83□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 FSCN2O14926 492 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 SPTLC1O15269 473 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TADA3O75528 432 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 VNN1O95497 513 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 GNA14O95837 355 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 SOD2P04179 222 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TPM1P09493 284 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 IRS1P35568 1242 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 GCLMP48507 274 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAF6P49848 677 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 AP3M2P53677 418 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ERVFC1P60507 584 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 BIRC3Q13489 604 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ADGRE1Q14246 886 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZACNQ401N2 412 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 VPS52Q8N1B4 723 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 MYLIPQ8WY64 445 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 B3GALT6Q96L58 329 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ZNF560Q96MR9 790 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 DNAJC7Q99615 494 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 PHACTR2O75167 634 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CTSAP10619 480 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TKTP29401 623 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CASQ1P31415 396 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 GLUD2P49448 558 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 MXI1P50539 228 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 LILRA4P59901 499 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 GNG11P61952 73 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 RBP5P82980 135 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 UBXN1Q04323 297 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 SV2CQ496J9 727 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CBWD6Q4V339 395 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 RTP2Q5QGT7 225 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 PLPP4Q5VZY2 271 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 SV2AQ7L0J3 742 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 SUSD3Q96L08 255 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TCF25Q9BQ70 676 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PRAMEF10-201ENST00000235347 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms