RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	DPPA5	A6NC42	116 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	STRN	O43815	780 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	KLRC1	P26715	233 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	MDM1	Q8TC05	714 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	FAM167A	Q96KS9	214 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	GCNT4	Q9P109	453 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	16.29	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	KRIT1	O00522	736 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	DAPK3	O43293	454 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	CEP104	O60308	925 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	LGR5	O75473	907 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	KRT16	P08779	473 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM49	P0CI25	452 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TRIM49C	P0CI26	452 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	IMPDH2	P12268	514 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	UCHL3	P15374	230 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	CALB2	P22676	271 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ADORA2A	P29274	412 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	PCK1	P35558	622 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TTLL4	Q14679	1199 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ANO7	Q6IWH7	933 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	IRGC	Q6NXR0	463 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ARMCX2	Q7L311	632 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM143	Q96AN5	459 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SIX2	Q9NPC8	291 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	PPME1	Q9Y570	386 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		16.28	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	FAM187A	A6NFU0	413 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	TLR2	O60603	784 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	RNF8	O76064	485 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ARL2	P36404	184 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SNX1	Q13596	522 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	CST9	Q5W186	159 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA33	Q96N06	139 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	PTPN18	Q99952	460 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	MCM3AP	O60318	1980 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	PLXNB2	O15031	1838 aa		16.27	■□□□□ 0.2
BBS1-225	ENST00000630659	ATP5D	P30049	168 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	ADSS	P30520	456 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	VAMP7	P51809	220 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	PMS2	P54278	862 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	ASIC2	Q16515	512 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	RNF43	Q68DV7	783 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	GLG1	Q92896	1179 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	COPS5	Q92905	334 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	PARP2	Q9UGN5	583 aa		16.27	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	COQ9	O75208	318 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	GLRA2	P23416	452 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	MAGEA8	P43361	318 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	MYL7	Q01449	175 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	ACVR2B	Q13705	512 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	CBWD6	Q4V339	395 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	STK32A	Q8WU08	396 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	KCNN1	Q92952	543 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM237	Q96Q45	408 aa		16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	16.26	■□□□□ 0.19
BBS1-225	ENST00000630659	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		16.25	■□□□□ 0.19

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