RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP68Q76N32 757 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX29Q8TEQ0 813 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 MSANTD3Q96H12 275 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB8Q9UN66 801 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 F5P12259 2224 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRU2 124 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 HRO43593 1189 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHA5P54756 1037 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 PGLYRP2Q96PD5 576 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 PLD1Q13393 1074 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 CSRP2Q16527 193 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf228Q6PIY5 440 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS1R3Q7RTX0 852 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 LONP2Q86WA8 852 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 GPIHBP1Q8IV16 184 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC8Q8TAM2 541 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf76Q96K31 380 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 DRC1Q96MC2 740 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 DPYSL4O14531 572 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 CNR2P34972 360 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 SEZ6Q53EL9 994 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZS52 159 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPRY1Q96DX4 576 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 DNM3Q9UQ16 869 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 E9PMD0 336 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ARNTLO00327 626 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 CHADO15335 359 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A4O15374 487 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 GDF9O60383 454 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4Q2P0C623 313 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 PROZP22891 400 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.375e-6■■□□□ 12.9
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHB3P54753 998 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 STRN3Q13033 797 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 DAW1Q8N136 415 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 USP37Q86T82 979 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 RUSC1Q9BVN2 902 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB34Q9BZG1 259 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 STK24Q9Y6E0 443 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 COL4A2P08572 1712 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ABLIM1O14639 778 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH1A3P47895 512 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NEK4P51957 841 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 NBR1Q14596 966 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 DGKKQ5KSL6 1271 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 STXBP5Q5T5C0 1151 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 IL31Q6EBC2 164 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 HAUS6Q7Z4H7 955 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-217ENST00000629983 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ESF4 209 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 SPAG1Q07617 926 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP4Q13115 394 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC10A6Q3KNW5 377 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TMC8Q8IU68 726 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM130Q8N3G9 435 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 SFI1A8K8P3 1242 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TOM1L1O75674 476 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL8P10145 99 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CTHP32929 405 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 FCHO2Q0JRZ9 810 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 PON2Q15165 354 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT79Q5XKE5 535 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNDC11Q6PKC3 985 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 DSTYKQ6XUX3 929 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF12Q96FN5 646 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFYVE19Q96K21 471 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN3LQ9H3M9 355 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 ST3GAL1Q11201 340 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 BEST2Q8NFU1 509 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC3Q9BY71 257 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC25Q9H1X3 360 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 CRISPLD1Q9H336 500 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIP11Q15643 1979 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 MYBPHLA2RUH7 354 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6C75A6NL08 312 aa29.79■■■□□ 2.36
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