RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 SYN3O14994 580 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CUTAO60888 179 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP6R2O75170 966 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 LRG1P02750 347 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FSHRP23945 695 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CASP5P51878 434 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ROR1Q01973 937 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNA1Q09470 495 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB33AQ14088 237 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 LILRA6Q6PI73 481 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF720Q7Z2F6 126 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 USP37Q86T82 979 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 APPL2Q8NEU8 664 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 HVCN1Q96D96 273 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAJC19Q96DA6 116 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SAAL1Q96ER3 474 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SUSD3Q96L08 255 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ACCSQ96QU6 501 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 MYADMQ96S97 322 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXL21Q9UKT6 434 aa11.58□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ANK1P16157 1881 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR27A2RRH5 827 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PPEF2O14830 753 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM189A1O60320 539 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 RFX1P22670 979 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CDR1P51861 262 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SHC4Q6S5L8 630 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP26C1Q6V0L0 522 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 UBALD2Q8IYN6 164 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ING5Q8WYH8 240 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 HPS3Q969F9 1004 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 BACE2Q9Y5Z0 518 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 DOCK6Q96HP0 2047 aa11.57□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 OR4Q2P0C623 313 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 LRPAP1P30533 357 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 AMPD3Q01432 767 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ADCY1Q08828 1119 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TDGQ13569 410 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 POSTNQ15063 836 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CD302Q8IX05 232 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXL6Q8N531 539 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 IQUBQ8NA54 791 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ASIC4Q96FT7 647 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC27Q9C0I9 530 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 BLZF1Q9H2G9 400 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TNMDQ9H2S6 317 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNK12Q9HB15 430 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CFAP45Q9UL16 551 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 TCHHQ07283 1943 aa11.56□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CFHP08603 1231 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ODC1P11926 461 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP3A5P20815 502 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CASP1P29466 404 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 HOXA9P31269 272 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 PLA2G5P39877 138 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 AFMP43652 599 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ALCAMQ13740 583 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 E2F4Q16254 413 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SPATA1Q5VX52 437 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC8B1Q6J4K2 584 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ELMOD1Q8N336 334 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 FLCNQ8NFG4 579 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF461Q8TAF7 563 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 ITFG1Q8TB96 612 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 KCNN1Q92952 543 aa11.55□□□□□ -0.56
EFTUD2-209ENST00000587957 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms