RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SWSAP1Q6NVH7 229 aa27.26■■□□□ 1.96
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CAPNS1-204ENST00000587718 ISCUQ9H1K1 167 aa27.26■■□□□ 1.96
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CAPNS1-204ENST00000587718 XIRP2A4UGR9 3374 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-204ENST00000587718 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
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