RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-211ENST00000580814 Q6ZRM9 215 aa6.93□□□□□ -1.3
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TSG101-211ENST00000580814 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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TSG101-211ENST00000580814 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.9□□□□□ -1.3
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TSG101-211ENST00000580814 ITGB1P05556 798 aa6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 THP07101 528 aa6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 KITP10721 976 aa6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 SLC5A1P13866 664 aa6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 NOMO3P69849 1222 aa6.89□□□□□ -1.31
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TSG101-211ENST00000580814 TCF15Q12870 199 aa6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 PHKBQ93100 1093 aa6.89□□□□□ -1.31
TSG101-211ENST00000580814 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.89□□□□□ -1.31
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