RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCEAL5Q5H9L2 206 aa35.68■■■■□ 3.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TKTP29401 623 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TYRO3Q06418 890 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 BIRC3Q13489 604 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC40Q4G0X9 1142 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCARA3Q6AZY7 606 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDXDC1Q6P996 788 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 DSTYKQ6XUX3 929 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3R5Q8WYR1 880 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO1EQ12965 1108 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZACNQ401N2 412 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SV2AQ7L0J3 742 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHB8Q9UN66 801 aa35.67■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF37A1IGU5 675 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 KPNA7A9QM74 516 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHACTR2O75167 634 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CST3P01034 146 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTF2H1P32780 548 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPC3Q13507 836 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 APPL2Q8NEU8 664 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 SENP8Q96LD8 212 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TLE6Q9H808 572 aa35.66■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX10O60499 249 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 MARSP56192 900 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CREMQ03060 361 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP3CAQ08209 521 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCERG1LQ5VWI1 586 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKS3Q6ZW76 656 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 EYSQ5T1H1 3165 aa35.65■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 ODC1P11926 461 aa35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 HPDLQ96IR7 371 aa35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 RXFP1Q9HBX9 757 aa35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 REV3LO60673 3130 aa35.64■■■■□ 3.3
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC192P0DO97 292 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 GCLMP48507 274 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRIP1P48552 1158 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMD5Q16401 504 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35C1Q96A29 364 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM8AQ9HCN3 771 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNIP2Q9P278 1114 aa35.63■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 FSD2A1L4K1 749 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNPP09543 421 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 HYAL1Q12794 435 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCOA4Q13772 614 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP6Q16828 381 aa35.62■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC25Q9H1X3 360 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMRN2Q9H8L6 949 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 GDAP2Q9NXN4 497 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYCE3A1L190 88 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYB561D2O14569 222 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PER2O15055 1255 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TYMPP19971 482 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATICP31939 592 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT39Q6A163 491 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPM1EQ8WY54 764 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL5Q96PQ7 755 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 THAP9Q9H5L6 903 aa35.62■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX28O15482 410 aa35.61■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 VNN1O95497 513 aa35.61■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTRRQ9UBK8 725 aa35.61■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 DSEQ9UL01 958 aa35.61■■■■□ 3.29
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NCK2O43639 380 aa35.6■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP11A1P05108 521 aa35.6■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADH1AP07327 375 aa35.6■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 MXI1P50539 228 aa35.6■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYL6P60660 151 aa35.6■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX9Q9Y5X1 595 aa35.6■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 BACE2Q9Y5Z0 518 aa35.6■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 H7C4K7 107 aa35.59■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP35.59■■■■□ 3.297e-25■■□□□ 11.7
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CTDNEP1-209ENST00000574205 XYLT2Q9H1B5 865 aa35.59■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 VRTNQ9H8Y1 702 aa35.59■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 OAZ2O95190 189 aa35.58■■■■□ 3.29
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL17P18621 184 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
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