RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-208	ENST00000564123	GJB1	P08034	283 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	HDC	P19113	662 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	SLC7A1	P30825	629 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	KCNJ5	P48544	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	NEK3	P51956	506 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	CHN2	P52757	468 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	RABGGTB	P53611	331 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	SOX8	P57073	446 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	NOMO3	P69849	1222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	GPSM2	P81274	684 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	APOA5	Q6Q788	366 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-208	ENST00000564123	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	LEFTY2	O00292	366 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CYP27B1	O15528	508 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SLC43A1	O75387	559 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	USP19	O94966	1318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	AGFG2	O95081	481 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	HRG	P04196	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	BRAF	P15056	766 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NPR1	P16066	1061 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MGAT1	P26572	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MAN2A2	P49641	1150 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SCNN1G	P51170	649 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NHLH2	Q02577	135 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PICALM	Q13492	652 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MNT	Q99583	582 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PRSS23	O95084	383 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	GNAI2	P04899	355 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RARB	P10826	455 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	FCER1A	P12319	257 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	BRD3	Q15059	726 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	NEU1	Q99519	415 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123		M0QYG6	137 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	TBX3	O15119	743 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PEX14	O75381	377 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	MYF5	P13349	255 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SLC5A1	P13866	664 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PHKG2	P15735	406 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	RHBDL3	P58872	404 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BBS2-208	ENST00000564123	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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