RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	IER5L	Q5T953	404 aa		23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	TSC2	P49815	1807 aa		23.6	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	GART	P22102	1010 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR4	Q13639	388 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	RESP18	Q5W5W9	173 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ITFG1	Q8TB96	612 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF13	Q92913	245 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP45	Q9UL16	551 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH7	Q9ULB5	785 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	MAFF	Q9ULX9	164 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	TYMP	P19971	482 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PAX3	P23760	479 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ME1	P48163	572 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT7B	P56706	349 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	AMPD3	Q01432	767 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	HPS3	Q969F9	1004 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		23.59	■■□□□ 1.37
PPP4C-205	ENST00000563200	PRRG1	O14668	218 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	IL18RAP	O95256	599 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	VNN2	O95498	520 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	DMD	P11532	3685 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	AVPR2	P30518	371 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ELF1	P32519	619 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXD13	P35453	343 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SAAL1	Q96ER3	474 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SENP8	Q96LD8	212 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM206	Q9H813	350 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	DPP3	Q9NY33	737 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		23.58	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	23.57	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	EHHADH	Q08426	723 aa		23.57	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCY1	Q08828	1119 aa		23.57	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		23.57	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		23.57	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	23.57	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		23.57	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6C75	A6NL08	312 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	LRG1	P02750	347 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP11A1	P05108	521 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	RHO	P08100	348 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEH	Q6S545	545 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	USP37	Q86T82	979 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS33	Q8NF86	280 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF14	Q92915	247 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	BORCS6	Q96GS4	357 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		23.56	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	EXTL3	O43909	919 aa		23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CPB1	P15086	417 aa		23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPN2	P17706	415 aa		23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ASIC1	P78348	528 aa		23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR17	Q13304	367 aa		23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PARM1	Q6UWI2	310 aa		23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	USP34	Q70CQ2	3546 aa		23.55	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	TCHH	Q07283	1943 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4Q2	P0C623	313 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	SRF	P11831	508 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ODC1	P11926	461 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	NPR3	P17342	541 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MYBPC2	Q14324	1141 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf38	Q8TB03	319 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT16	Q9UBV4	365 aa		23.54	■■□□□ 1.36
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	23.54	■■□□□ 1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms