RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558379.5

TLE3-213, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TLE3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-213	ENST00000558379	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	ASAP2	O43150	1006 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	B4GALT4	O60513	344 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	PHKA2	P46019	1235 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	BPIFB4	P59827	614 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	ORC1	Q13415	861 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	CIT	O14578	2027 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	RNF40	O75150	1001 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	MAPK4	P31152	587 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	CDH8	P55286	799 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	PPFIA1	Q13136	1202 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	HIC1	Q14526	733 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	GRIK4	Q16099	956 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	KRT19	P08727	400 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	PSEN1	P49768	467 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	AP3M2	P53677	418 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	HUNK	P57058	714 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	PAK2	Q13177	524 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	TRPC3	Q13507	836 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	CCL14	Q16627	93 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	MAGEB2	O15479	319 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	GPS2	Q13227	327 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	FAM71B	Q8TC56	605 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TLE3-213	ENST00000558379	TSPAN1	O60635	241 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	ITGB3	P05106	788 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	TCF4	P15884	667 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	CTNNA2	P26232	953 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	CYP2C19	P33261	490 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	SCN1A	P35498	2009 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	ZIM3	Q96PE6	472 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	KRT14	P02533	472 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	RARA	P10276	462 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	MMP8	P22894	467 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	TAS2R40	P59535	323 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	KAT2B	Q92831	832 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	ARL8A	Q96BM9	186 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TLE3-213	ENST00000558379	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28

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