RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555653.1

MIS18BP1-211, Transcript of MIS18 binding protein 1, human

TSL 2

Gene MIS18BP1, Length 429 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ANXA1	P04083	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HK1	P19367	917 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PCSK1	P29120	753 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ST8SIA2	Q92186	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MRI1	Q9BV20	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653		A0A1W2PPL8	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LPXN	O60711	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	POMC	P01189	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ITGB1	P05556	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CD1A	P06126	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	BRD3	Q15059	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CSRP2	Q16527	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KCNH6	Q9H252	994 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	USP25	Q9UHP3	1055 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CFAP69	A5D8W1	941 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	F2RL2	O00254	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GRM6	O15303	877 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HAUS5	O94927	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FPR1	P21462	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PRDX5	P30044	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PLS1	Q14651	629 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIS18BP1-211	ENST00000555653		A6NNZ2	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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