RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GAST	P01350	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RAP2A	P10114	183 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	IL2RB	P14784	551 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DDC	P20711	480 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CSF2RB	P32927	897 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CRHR1	P34998	444 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SLC6A9	P48067	706 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	AFF3	P51826	1226 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	HK3	P52790	923 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	AK2	P54819	239 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RAB1A	P62820	205 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CREM	Q03060	361 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ACAP1	Q15027	740 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	VPS72	Q15906	364 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SRL	Q86TD4	932 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	FAM124A	Q86V42	546 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MORC1	Q86VD1	984 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	REPS2	Q8NFH8	660 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MDM1	Q8TC05	714 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	FAM167A	Q96KS9	214 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CPA4	Q9UI42	421 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NR2E1	Q9Y466	385 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ABCC11	Q96J66	1382 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089		A0A088AWK7	358 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ADCY6	O43306	1168 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SASH1	O94885	1247 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MAL	P21145	153 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CASR	P41180	1078 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NPEPPS	P55786	919 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	APBA1	Q02410	837 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PLS1	Q14651	629 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	VMAC	Q2NL98	169 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LONRF3	Q496Y0	759 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	VWA3B	Q502W6	1294 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ARL8A	Q96BM9	186 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NT5C1B	Q96P26	610 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TBCB	Q99426	244 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		5	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ALS2	Q96Q42	1657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DLC1	Q96QB1	1528 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TEX33	O43247	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	B4GALT4	O60513	344 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TYR	P14679	529 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GJA9	P57773	515 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LINC00310	P59036	64 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PTH1R	Q03431	593 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MORC3	Q14149	939 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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