RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 A0A087WZ62 844 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 UQCRHLA0A096LP55 91 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 A0A1W2PQY0 241 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 KBTBD13C9JR72 458 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 K7ERI5 159 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 EREGO14944 169 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 AP5Z1O43299 807 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PHACTR2O75167 634 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GPR32O75388 356 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 VTNP04004 478 aa6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 UQCRHP07919 91 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 EN2P19622 333 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 SERPINB4P48594 390 aa6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 MYBPC2Q14324 1141 aa6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SERINC5Q86VE9 423 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF410Q86VK4 478 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 NME8Q8N427 588 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 RNF149Q8NC42 400 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 TSG101Q99816 390 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 GBP3Q9H0R5 595 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 C2orf40Q9H1Z8 148 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FZD8Q9H461 694 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 THAP9Q9H5L6 903 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.7□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.7□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 CLIC2O15247 247 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 EPHA1P21709 976 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GJA8P48165 433 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MBTD1Q05BQ5 628 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 PTGISQ16647 500 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SARM1Q6SZW1 724 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.69□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 WNT8BQ93098 351 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 NLRP4Q96MN2 994 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa6.69□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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