RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530658.1

LGR4-206, Transcript of leucine rich repeat containing G protein-coupled receptor 4, human

TSL 4

Gene LGR4, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LGR4-206	ENST00000530658	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	BRAF	P15056	766 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	GCSH	P23434	173 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	TM4SF4	P48230	202 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	KCNJ5	P48544	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	NHLH2	Q02577	135 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	BRD3	Q15059	726 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	MAML1	Q92585	1016 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	PHKB	Q93100	1093 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658		K7ESM1	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	DNAJB5	O75953	348 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ABHD16A	O95870	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	GNAI2	P04899	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	FCER1A	P12319	257 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SELENOP	P49908	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	FMO1	Q01740	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CRHR2	Q13324	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CNGA2	Q16280	664 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	LONRF1	Q17RB8	773 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	PMM1	Q92871	262 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	TBCB	Q99426	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	KPNA5	O15131	536 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ZNF185	O15231	689 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	UNC5C	O95185	931 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CHEK2	O96017	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CKB	P12277	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	PRIM2	P49643	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CASP5	P51878	434 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	AK2	P54819	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	PLP2	Q04941	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	TCF15	Q12870	199 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	GJA10	Q969M2	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	XDH	P47989	1333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LGR4-206	ENST00000530658	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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