RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 CUL2Q13617 745 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 BOLA3Q53S33 107 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FBXL16Q8N461 479 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM169Q96HH4 297 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PAK5Q9P286 719 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PIK3R2O00459 728 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 MYO1DO94832 1006 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC2A3P11169 496 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 DDX5P17844 614 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SHMT1P34896 483 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 MYBPC2Q14324 1141 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 GTF3C4Q9UKN8 822 aa18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TC2NQ8N9U0 490 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FEZF2Q8TBJ5 459 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 OPTNQ96CV9 577 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 DNAJC6O75061 913 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TFRCP02786 760 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PDCLQ13371 301 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM47EQ6ZV65 393 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SH3KBP1Q96B97 665 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 F5H423 210 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 KBTBD4Q9NVX7 518 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 L3MBTL1Q9Y468 752 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 H7C4K7 107 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SPAG6O75602 509 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TBCCQ15814 346 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 BTBD6Q96KE9 485 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 WDR24Q96S15 920 aa18.32■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 HARS2P49590 506 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 HERVK_113P62684 666 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 GRIN1Q05586 938 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SCFD1Q8WVM8 642 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 GRAMD1AQ96CP6 724 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 CENPKQ9BS16 269 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 APRTP07741 180 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PYGBP11216 843 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 NPTX2P47972 431 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 DCAF6Q58WW2 860 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TMC2Q8TDI7 906 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 COG1Q8WTW3 980 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 NAGPAQ9UK23 515 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PGK2P07205 417 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 SERPINB9P50453 376 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 CCZ1BP86790 482 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 DACT2Q5SW24 774 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FAM117BQ6P1L5 589 aa18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 GYPCP04921 128 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 GUCY2CP25092 1073 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 ESRRGP62508 458 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 IL31Q6EBC2 164 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 KIFC3Q9BVG8 833 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 ANP32DO95626 131 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 KLRC1P26715 233 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 CENPCQ03188 943 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 GTF2H3Q13889 308 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 KLHL11Q9NVR0 708 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 NFIBO00712 420 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 WNT10BO00744 389 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 HMBSP08397 361 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 COMTP21964 271 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 CLCN3P51790 818 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PTDSS1-202ENST00000517309 CCDC138Q96M89 665 aa18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms