RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515854.5

ATP2C1-223, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 4

Gene ATP2C1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRR20E	P86478	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRR20C	P86479	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRR20D	P86480	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRR20B	P86481	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRR20A	P86496	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	BEX3	Q00994	111 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ITIH3	Q06033	890 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ELF2	Q15723	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CD302	Q8IX05	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM192	Q8IY95	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NME8	Q8N427	588 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TAF4B	Q92750	862 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ARID3A	Q99856	593 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF185	O15231	689 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SEPT4	O43236	478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ERLIN2	O94905	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	KIF4A	O95239	1232 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FTCD	O95954	541 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CYP1A2	P05177	515 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NFIC	P08651	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	KRT5	P13647	590 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ABCB4	P21439	1286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	FGFR4	P22455	802 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ATIC	P31939	592 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CAP1	Q01518	475 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SP3	Q02447	781 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRPC3	Q13507	836 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SNX17	Q15036	470 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TAF3	Q5VWG9	929 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATP2C1-223	ENST00000515854	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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