RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 BTBD18B2RXH4 712 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 BTBD19C9JJ37 291 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GSTA4O15217 222 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TLR2O60603 784 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 DTNBO60941 627 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SOD2P04179 222 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 JMJD7P0C870 316 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SSTR4P31391 388 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 COPB2P35606 906 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TRAPPC10P48553 1259 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 OAZ1P54368 228 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RESTQ13127 1097 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCDC174Q6PII3 467 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FLCNQ8NFG4 579 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PCDH19Q8TAB3 1148 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 COA7Q96BR5 231 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MAF1Q9H063 256 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 EBF1Q9UH73 591 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PPC1 479 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 H7BY64 318 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 VWA5AO00534 786 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ICAM1P05362 532 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 POLR2MP0CAP2 368 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCL5P13501 91 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 BCL6P41182 706 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RTP1P59025 263 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 STK38Q15208 465 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 USH1GQ495M9 461 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 KIF18BQ86Y91 864 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 Q8N1Y9 231 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 OXR1Q8N573 874 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 JMJD8Q96S16 334 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FITM1A5D6W6 292 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 YEATS4O95619 227 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GJB1P08034 283 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CPEP16870 476 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GRK2P25098 689 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GRK3P35626 688 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 NFKB2Q00653 900 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 NR0B2Q15466 257 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 C17orf99Q6UX52 265 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CPXCR1Q8N123 301 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 DEFB123Q8N688 67 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ASIC4Q96FT7 647 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TMEM169Q96HH4 297 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 CDIP1Q9H305 208 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SAMD15Q9P1V8 674 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SRRDQ9UH36 339 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FBXO40Q9UH90 709 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 DOCK1Q14185 1865 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 LTBP2Q14767 1821 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 ATP2A1O14983 1001 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 FIBPO43427 364 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 NRDCO43847 1150 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MARCH6O60337 910 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A27O95847 323 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-210ENST00000512194 MBD3O95983 291 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms