RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 LONP2Q86WA8 852 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 MICALL2Q8IY33 904 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ZFATQ9P243 1243 aa8.48□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 GOLGA8OA6NCC3 632 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 GOLGA8NF8WBI6 632 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PJA2O43164 708 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 EXTL3O43909 919 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 GZMAP12544 262 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 OVGP1Q12889 678 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 RSPH3Q86UC2 560 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ACAP3Q96P50 834 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SERPINB12Q96P63 405 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 USP20Q9Y2K6 914 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 APOL1O14791 398 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SLITRK3O94933 977 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 IL1R1P14778 569 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ELF1P32519 619 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CPA2P48052 419 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PTENP60484 403 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 IL1RL1Q01638 556 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 FAXCQ5TGI0 409 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 FAM71DQ8N9W8 422 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 UBA3Q8TBC4 463 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SLC5A5Q92911 643 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 TATDN2Q93075 761 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 WWP1Q9H0M0 922 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 KPNA7A9QM74 516 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PMLP29590 882 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 KCNMA1Q12791 1236 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ORC1Q13415 861 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 FSCBQ5H9T9 825 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 BBS5Q8N3I7 341 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 HAS1Q92839 578 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 GMCL1Q96IK5 515 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PPP1R36Q96LQ0 422 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 NOD2Q9HC29 1040 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 NDE1Q9NXR1 346 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 E2F8A0AVK6 867 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PFDN6O15212 129 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CCDC22O60826 627 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PDGFRBP09619 1106 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SCTRP47872 440 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ZNF844Q08AG5 666 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PTK7Q13308 1070 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CUL2Q13617 745 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 Q4G0T1 1027 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 RNF135Q8IUD6 432 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ABI1Q8IZP0 508 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PGBD4Q96DM1 585 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.47□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 TISP43B9A030 160 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ICAM1P05362 532 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PYGMP11217 842 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 KRT4P19013 534 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CAP2P40123 477 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 PBX1P40424 430 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CENPCQ03188 943 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 DNAJC19Q96DA6 116 aa8.46□□□□□ -1.05
NEK1-208ENST00000512193 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms