RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 OCA2Q04671 838 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CAMKK2Q96RR4 588 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CCDC78A2IDD5 438 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CDHR4A6H8M9 788 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 MYADML2A6NDP7 307 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 B3GALT2O43825 422 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 DTNBO60941 627 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CDKL5O76039 1030 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 GPANK1O95872 356 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 FOSP01100 380 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CYP2C19P33261 490 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 SLFN5Q08AF3 891 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 AGAP2Q99490 1192 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 WDR11Q9BZH6 1224 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 C11orf21Q9P2W6 132 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 NOX1Q9Y5S8 564 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 KIF21BO75037 1637 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 F2RL2O00254 374 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 AGFG2O95081 481 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 SPDEFO95238 335 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ANXA1P04083 346 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CD1AP06126 327 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 HK3P52790 923 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CXADRP78310 365 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 BLOC1S1P78537 153 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 HSD11B2P80365 405 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PCSK4Q6UW60 755 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 Q8NA96 180 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ZSWIM1Q9BR11 485 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 RNF181Q9P0P0 153 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 AATKQ6ZMQ8 1374 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 OVOL3O00110 214 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 AKAP10O43572 662 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 GCP02774 474 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PF4V1P10720 104 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 SMARCA1P28370 1054 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 RAB27AP51159 221 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 EPHB1P54762 984 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 SCAPQ12770 1279 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 TP53BP2Q13625 1128 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CYP2A13Q16696 494 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PGS1Q32NB8 556 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ZNF365Q70YC5 407 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PDSS2Q86YH6 399 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 GPR150Q8NGU9 434 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 NACC2Q96BF6 587 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 COQ10AQ96MF6 247 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 CYP4F11Q9HBI6 524 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 SYBUQ9NX95 663 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 USP25Q9UHP3 1055 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 UNC119BA6NIH7 251 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ERN1O75460 977 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 RFPL1O75677 317 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 RHOBTB3O94955 611 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 FCER1AP12319 257 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 TGM1P22735 817 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 NOGQ13253 232 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 SLC4A10Q6U841 1118 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 GPR149Q86SP6 731 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 LCORLQ8N3X6 602 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 HPS3Q969F9 1004 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 MVB12AQ96EY5 273 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE4D-220ENST00000512069 ADAMTSL3P82987 1691 aa5.9□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 FHAD1B1AJZ9 1412 aa5.9□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 PTPRMP28827 1452 aa5.9□□□□□ -1.47
PDE4D-220ENST00000512069 CUL7Q14999 1698 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 164.5 ms