RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 CAP2P40123 477 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PHKA2P46019 1235 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ATP6V0D1P61421 351 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ADSSL1Q8N142 457 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 AFG1LQ8WV93 481 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OMA1Q96E52 524 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM47Q96LD4 638 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CLPBQ9H078 707 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 UCK1Q9HA47 277 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 S100A14Q9HCY8 104 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 AMACRQ9UHK6 382 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 VPS4AQ9UN37 437 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.51□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PLA2R1Q13018 1463 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SSH2Q76I76 1423 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CAPN8A6NHC0 703 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LRRIQ4A6NIV6 560 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CCRL2O00421 344 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SNX4O95219 450 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GAS8O95995 478 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FAM228BP0C875 321 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 STX2P32856 288 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ATP5OP48047 213 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RGS7P49802 495 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CENPCQ03188 943 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FAM205BPQ63HN1 556 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 KSR2Q6VAB6 950 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RASSF3Q86WH2 238 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 HID1Q8IV36 788 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PALM2Q8IXS6 379 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CENPSQ8N2Z9 138 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SUPT20HQ8NEM7 779 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 THAP9Q9H5L6 903 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ARMC7Q9H6L4 198 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CD209Q9NNX6 404 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 POLE3Q9NRF9 147 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D22BQ9NU19 505 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PIK3C2GO75747 1445 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MYOM2P54296 1465 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 FAM170AA1A519 330 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 K7EPI3 171 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB43O43298 467 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 SSX5O60225 188 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RASGRP1O95267 797 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM27P14373 513 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 GJB2P29033 226 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 L1CAMP32004 1257 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CNGA2Q16280 664 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP161Q6P656 301 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ACAD11Q709F0 780 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TC2NQ8N9U0 490 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 RIN3Q8TB24 985 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TRIM63Q969Q1 353 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM237Q96Q45 408 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PLIN2Q99541 437 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.5□□□□□ -1.37
PDE4D-216ENST00000507116 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.5□□□□□ -1.37
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