RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC66A2RUB6 948 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY6O43306 1168 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZEB2O60315 1214 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TNNC2P02585 160 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 VTNP04004 478 aa8.75□□□□□ -1.01
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PDE4D-208ENST00000502484 ITGA4P13612 1032 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CTNNA2P26232 953 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PRKCZQ05513 592 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PPFIA1Q13136 1202 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NNTQ13423 1086 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TRPC3Q13507 836 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GRIK4Q16099 956 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PPP2R5EQ16537 467 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MORN1Q5T089 497 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MARCH8Q5T0T0 291 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NAA35Q5VZE5 725 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PDZD7Q9H5P4 517 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SRRDQ9UH36 339 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GABRQQ9UN88 632 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CLSTN1O94985 981 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CYP2B6P20813 491 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FLT3LGP49771 235 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 OSTNP61366 133 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MAP2K5Q13163 448 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PAK2Q13177 524 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM192Q8IY95 271 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF606Q8WXB4 792 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 BTBD6Q96KE9 485 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 XYLT2Q9H1B5 865 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MED4Q9NPJ6 270 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GJD2Q9UKL4 321 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ESYT3A0FGR9 886 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 A6NJR5 290 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 THAP12O43422 761 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SPOPO43791 374 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CFHP08603 1231 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 STAG3L1P0CL83 205 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 RRM1P23921 792 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ASPAP45381 313 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MARCKSL1P49006 195 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FAM193AP78312 1265 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TERF2Q15554 542 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 KYAT1Q16773 422 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF699Q32M78 642 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MAATS1Q7Z4T9 603 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF410Q86VK4 478 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC26Q8TAB7 109 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 RAET1EQ8TD07 263 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ASB7Q9H672 318 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CISHQ9NSE2 258 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.74□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NFU1Q9UMS0 254 aa8.74□□□□□ -1.01
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PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 LACTBL1A8MY62 500 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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PDE4D-208ENST00000502484 PTP4A2Q12974 167 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CUL1Q13616 776 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FAM71BQ8TC56 605 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NLRP7Q8WX94 980 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SEC14L1Q92503 715 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CPB2Q96IY4 423 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 AMACRQ9UHK6 382 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SIX4Q9UIU6 781 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NR2E1Q9Y466 385 aa8.73□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GUA9 196 aa8.73□□□□□ -1.01
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