RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497425.1

TTC21B-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, human

TSL 3

Gene TTC21B, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC21B-208	ENST00000497425	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TTC21B-208	ENST00000497425	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TTC21B-208	ENST00000497425	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TTC21B-208	ENST00000497425	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TTC21B-208	ENST00000497425	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TTC21B-208	ENST00000497425	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TTC21B-208	ENST00000497425	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TTC21B-208	ENST00000497425	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	NPR1	P16066	1061 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	MAK	P20794	623 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PIK3CG	P48736	1102 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	DGCR2	P98153	550 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	FMO1	Q01740	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	GRM7	Q14831	915 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PHKB	Q93100	1093 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	VOPP1	Q96AW1	172 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425		B5MCH6	92 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	TBX3	O15119	743 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	KPNA5	O15131	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	FRS3	O43559	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	GNAI3	P08754	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	C1S	P09871	688 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	ACRV1	P26436	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	KCNJ5	P48544	419 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PRIM2	P49643	509 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SOX8	P57073	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	CLRN1	P58418	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	GNAI1	P63096	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	NOMO3	P69849	1222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	MORC3	Q14149	939 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	CNGA2	Q16280	664 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	GJA10	Q969M2	543 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	MYO1F	O00160	1098 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	PJA2	O43164	708 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC43A1	O75387	559 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	POMC	P01189	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	GJB1	P08034	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	BRAF	P15056	766 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	SLC6A4	P31645	630 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC21B-208	ENST00000497425	HTR3A	P46098	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms