RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 NCAM2O15394 837 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 PIGRP01833 764 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 CD72P21854 359 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ID4P47928 161 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 LIG4P49917 911 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 EPHA5P54756 1037 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TWF1Q12792 350 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF852Q6ZMS4 543 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ERMP1Q7Z2K6 904 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 CALML4Q96GE6 196 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 REEP2Q9BRK0 252 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 HEBP1Q9NRV9 189 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP72Q9P209 647 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM189A1O60320 539 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TARSP26639 723 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TNFSF9P41273 254 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 RPS9P46781 194 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF131P52739 623 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 SPAG1Q07617 926 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 GPBP1Q86WP2 473 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ASAH2Q9NR71 780 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TBX20Q9UMR3 447 aa24.54■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 OGTO15294 1046 aa24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 KINO60870 393 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ADRB2P07550 413 aa24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 UBA7P41226 1012 aa24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 HS6ST3Q8IZP7 471 aa24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 SMARCD2Q92925 531 aa24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 BRD9Q9H8M2 597 aa24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 PARVGQ9HBI0 331 aa24.53■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 OR6C75A6NL08 312 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 LACTBL1A8MY62 500 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 K7ENM7 598 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTLC1O15269 473 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 MOSPD3O75425 235 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM13AO94988 1023 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 BMP15O95972 392 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCD1P33897 745 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 MCM2P49736 904 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 PLD1Q13393 1074 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 USP37Q86T82 979 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 MYCT1Q8N699 235 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 RUBCNQ92622 972 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 IRF7Q92985 503 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPV4Q9HBA0 871 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPV5Q9NQA5 729 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 YIPF1Q9Y548 306 aa24.52■■□□□ 1.52
TRDMT1-211ENST00000495022 DENND4CQ5VZ89 1909 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 SHISA7A6NL88 538 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 TYMPP19971 482 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 GRM2Q14416 872 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 CD302Q8IX05 232 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC15Q8TF66 581 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0B4J269 797 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MAN2B1O00754 1011 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 VNN2O95498 520 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MYL4P12829 197 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMC3P17980 439 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 PAX3P23760 479 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR17Q13304 367 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 VITQ6UXI7 678 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 SUMF1Q8NBK3 374 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSWIM3Q96MP5 696 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR88Q9GZN0 384 aa24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAK2O60296 914 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 PLCG1P19174 1290 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 FZD5Q13467 585 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MYBPC2Q14324 1141 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA1Q5VX52 437 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 OVOS1Q6IE37 1185 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 BRAPQ7Z569 592 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 RAD54LQ92698 747 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 HINFPQ9BQA5 517 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 OR4Q2P0C623 313 aa24.48■■□□□ 1.51
TRDMT1-211ENST00000495022 GUCY2FP51841 1108 aa24.48■■□□□ 1.51
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