RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 PLCG1P19174 1290 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 LIG4P49917 911 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 PRKCQQ04759 706 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TPGS2Q68CL5 300 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A4Q6P5W5 647 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TPRG1Q6ZUI0 275 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 MYCT1Q8N699 235 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 APPL2Q8NEU8 664 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 FAM212AQ96EL1 285 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 IKZF4Q9H2S9 585 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ZHX3Q9H4I2 956 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 GDE1Q9NZC3 331 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 KCND2Q9NZV8 630 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TBX20Q9UMR3 447 aa13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 COL4A2P08572 1712 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ANKRD63C9JTQ0 380 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 M0QZQ0 153 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 FAM13AO94988 1023 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 LMNAP02545 664 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 MYL4P12829 197 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 NMT1P30419 496 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 LRPAP1P30533 357 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 UBA7P41226 1012 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 PPP2R3AQ06190 1150 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 GPIHBP1Q8IV16 184 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TTC9BQ8N6N2 239 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ELSPBP1Q96BH3 223 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 CALML4Q96GE6 196 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 CHAMP1Q96JM3 812 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ASB16Q96NS5 453 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TMEM209Q96SK2 561 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 FIZ1Q96SL8 496 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ODF2LQ9ULJ1 636 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 YIPF1Q9Y548 306 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TSC2P49815 1807 aa13.73□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 SPTLC1O15269 473 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 OGTO15294 1046 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 VIPR2P41587 438 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ZNF131P52739 623 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 PFKPQ01813 784 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TEAD2Q15562 447 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 JADE1Q6IE81 842 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 VITQ6UXI7 678 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 USP49Q70CQ1 688 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 BRAPQ7Z569 592 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 KCTD17Q8N5Z5 321 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 RAD54LQ92698 747 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 AK8Q96MA6 479 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 MSTO1Q9BUK6 570 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 BCO2Q9BYV7 579 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 PARVGQ9HBI0 331 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ZFP14Q9HCL3 533 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 KCNG1Q9UIX4 513 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 SCN1AP35498 2009 aa13.72□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 A0A0B4J269 797 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 H0YCG3 227 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ZNF197O14709 1029 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TRAK2O60296 914 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 SOAT2O75908 522 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 OAZ2O95190 189 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 PIGRP01833 764 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 KRT18P05783 430 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 NFICP08651 508 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 CYP3A5P20815 502 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ACOT2P49753 483 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 DUSP4Q13115 394 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 FZD5Q13467 585 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 STXBP5Q5T5C0 1151 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 CYP4A22Q5TCH4 519 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 IQCEQ6IPM2 695 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 TSSK4Q6SA08 328 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 ELMOD1Q8N336 334 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 DCLK2Q8N568 766 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 BEST2Q8NFU1 509 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 RASSF8Q8NHQ8 419 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 SHKBP1Q8TBC3 707 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 EPSTI1Q96J88 318 aa13.71□□□□□ -0.21
PRAME-212ENST00000485532 LRRC3Q9BY71 257 aa13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms