RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	ODC1	P11926	461 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	FGFR3	P22607	806 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	KLRC2	P26717	231 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	GCLM	P48507	274 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	NRIP1	P48552	1158 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	ENPEP	Q07075	957 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	PSMD5	Q16401	504 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	METTL23	Q86XA0	190 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	APPL2	Q8NEU8	664 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	HPDL	Q96IR7	371 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	SENP8	Q96LD8	212 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019		M0QZQ0	153 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CREM	Q03060	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	NCOA4	Q13772	614 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	ZACN	Q401N2	412 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	MED15	Q96RN5	788 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	IRAK3	Q9Y616	596 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CIT	O14578	2027 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019		H7C4K7	107 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	HUS1	O60921	280 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	LILRB3	O75022	631 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	ADH1A	P07327	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	ATIC	P31939	592 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	GTF2H1	P32780	548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	MXI1	P50539	228 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	MYL6	P60660	151 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	HYAL1	Q12794	435 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	DUSP6	Q16828	381 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	KRT39	Q6A163	491 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	GPR65	Q8IYL9	337 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	MMS19	Q96T76	1030 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	DSE	Q9UL01	958 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM34-208	ENST00000485019	TEX28	O15482	410 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	NCK2	O43639	380 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TYMP	P19971	482 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ARPP19	P56211	112 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	TNNC1	P63316	161 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF699	Q32M78	642 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	CLDND1	Q9NY35	253 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM34-208	ENST00000485019	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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