RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 TLR10Q9BXR5 811 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 CDY2AQ9Y6F7 541 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF487B1APH4 448 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 ERLIN2O94905 339 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 EOMESO95936 686 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 TUBBP07437 444 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 CXCL8P10145 99 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 PDE6CP51160 858 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 C9orf57Q5W0N0 161 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 METTL13Q8N6R0 699 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 APBB2Q92870 758 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 KAT5Q92993 513 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM51Q9NW97 253 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 RAB21Q9UL25 225 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 IPPQ9Y573 584 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.9□□□□□ -1.3
PRKCI-202ENST00000476635 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 P4HA1P13674 534 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 GRK4P32298 578 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 RFC2P35250 354 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 RAD23BP54727 409 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 GALCP54803 685 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ITGA7Q13683 1181 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 LPIN1Q14693 890 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 TAZQ16635 292 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 CREG2Q8IUH2 290 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 PBKQ96KB5 322 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 PKMYT1Q99640 499 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SDCBP2Q9H190 292 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 DPP3Q9NY33 737 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 VWA8A3KMH1 1905 aa6.9□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 A0A0U1RQF3 1178 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 DPYSL4O14531 572 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 PTGESO14684 152 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 AKR1B10O60218 316 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 MMP8P22894 467 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SLC1A1P43005 524 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 GPC5P78333 572 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 GPNMBQ14956 572 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ACAP1Q15027 740 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 GNASQ5JWF2 1037 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 LRRC38Q5VT99 294 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 FAM71BQ8TC56 605 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ZBTB10Q96DT7 871 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 CPB2Q96IY4 423 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ALS2CR12Q96Q35 445 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 RNF19AQ9NV58 838 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 UMODL1Q5DID0 1318 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 M0QZQ0 153 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 VDRP11473 427 aa6.89□□□□□ -1.31
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PRKCI-202ENST00000476635 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 BEST2Q8NFU1 509 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 SEC14L1Q92503 715 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 MYH10P35580 1976 aa6.89□□□□□ -1.31
PRKCI-202ENST00000476635 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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