RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, human

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RUBCN-208	ENST00000471364	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	IQCD	Q96DY2	449 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ACCS	Q96QU6	501 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	DGAT1	O75907	488 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	AKAP3	O75969	853 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	AOC1	P19801	751 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC11A1	P49279	550 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CLCN4	P51793	760 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PEX3	P56589	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ZBED6	P86452	979 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	GTF2B	Q00403	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CEP89	Q96ST8	783 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	EPHB6	O15197	1021 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC16A4	O15374	487 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ALDH2	P05091	517 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNH2	Q12809	1159 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	SIX5	Q8N196	739 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KIFAP3	Q92845	792 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	HVCN1	Q96D96	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RUBCN-208	ENST00000471364	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	PI15	O43692	258 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	NPR3	P17342	541 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	ID4	P47928	161 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	CYP2J2	P51589	502 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	CHP1	Q99653	195 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	RSAD1	Q9HA92	442 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	DPP7	Q9UHL4	492 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	CCDC169	A6NNP5	214 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RUBCN-208	ENST00000471364	STK25	O00506	426 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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