RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466411.1

CLDN4-204, Transcript of claudin 4, humanhuman

TSL 4

Gene CLDN4, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4-204ENST00000466411 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 TRIML1Q8N9V2 468 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ASAP3Q8TDY4 903 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 BICD1Q96G01 975 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 PAGE5Q96GU1 130 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ACCSQ96QU6 501 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ADAM2Q99965 735 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 PANK2Q9BZ23 570 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.56□□□□□ -1.2
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CLDN4-204ENST00000466411 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.56□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 A0A087X0B3 334 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 MYMKA6NI61 221 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CLDN3O15551 220 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 TSPAN1O60635 241 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 FGF18O76093 207 aa7.55□□□□□ -1.2
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CLDN4-204ENST00000466411 GCNT3O95395 438 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CAPNS1P04632 268 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 MCF2P10911 925 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 PAX3P23760 479 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 LIG4P49917 911 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 GATMP50440 423 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 LIMK1P53667 647 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 COPS2P61201 443 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 DSC3Q14574 896 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CCDC6Q16204 474 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 LONRF3Q496Y0 759 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 COBLL1Q53SF7 1204 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ATF7IP2Q5U623 682 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.55□□□□□ -1.2
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CLDN4-204ENST00000466411 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 DYMQ7RTS9 669 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ZNF720Q7Z2F6 126 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 KSR1Q8IVT5 923 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CD302Q8IX05 232 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.55□□□□□ -1.2
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CLDN4-204ENST00000466411 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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CLDN4-204ENST00000466411 URGCPQ8TCY9 931 aa7.55□□□□□ -1.2
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CLDN4-204ENST00000466411 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CASP10Q92851 521 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SMARCE1Q969G3 411 aa7.55□□□□□ -1.2
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CLDN4-204ENST00000466411 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 TBX20Q9UMR3 447 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 LZTS1Q9Y250 596 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CITO14578 2027 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 LAMA1P25391 3075 aa7.55□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 C9IYK1 514 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SLC16A4O15374 487 aa7.54□□□□□ -1.2
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CLDN4-204ENST00000466411 TDGF1P13385 188 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 GARTP22102 1010 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 PPM1AP35813 382 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 AFMP43652 599 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 STARD6P59095 220 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 FAM189BP81408 668 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 MYBPC2Q14324 1141 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 SURF1Q15526 300 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 CSRP2Q16527 193 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 ZNF568Q3ZCX4 644 aa7.54□□□□□ -1.2
CLDN4-204ENST00000466411 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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