RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A087X0B3 334 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A0G2JLW4 131 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 TOMM70O94826 608 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 BPIP17213 487 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 UGT8Q16880 541 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 ITGB4P16144 1822 aa6.99□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 FLT4P35916 1363 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 B3GALT2O43825 422 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 HLA-DOAP06340 250 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBP3P10745 1247 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 CRHR1P34998 444 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 MXRA7P84157 204 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 AGAP2Q99490 1192 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 PKD1L3Q7Z443 1732 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa6.98□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 LCHNA4D1U4 455 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 DPEP1P16444 411 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 KRT4P19013 534 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 LGALS4P56470 323 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 FSTL1Q12841 308 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAPQ12884 760 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 NCAPD2Q15021 1401 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF480Q8WV37 535 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 PACSIN3Q9UKS6 424 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 RPTORQ8N122 1335 aa6.97□□□□□ -1.29
RPS3AP53-201ENST00000454716 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 ITGA10O75578 1167 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 MTHFD2P13995 350 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 SOX5P35711 763 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 PCSK4Q6UW60 755 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 Q6ZPA2 131 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.96□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 KDRP35968 1356 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIF24Q5T7B8 1368 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 TONSLQ96HA7 1378 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 BRINP1O60477 761 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 CFBP00751 764 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 GYS1P13807 737 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 PHKG2P15735 406 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 CPEP16870 476 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 KCNA3P22001 575 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 ENPP1P22413 925 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 NR4A1P22736 598 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 CTSSP25774 331 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 GYS2P54840 703 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMF1P82094 1093 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 CT83Q5H943 113 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 TFAP2CQ92754 450 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 WDR90Q96KV7 1748 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 KCPQ6ZWJ8 1503 aa6.95□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 BMPR1AP36894 532 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 AVPR1BP47901 424 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 USP14P54578 494 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 BLOC1S1P78537 153 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 XYLT1Q86Y38 959 aa6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RPS3AP53-201ENST00000454716 MLST8Q9BVC4 326 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms