RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448136.5

SNHG16-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNHG16, Length 3,607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-201ENST00000448136 SEMA4DQ92854 862 aa10.65□□□□□ -0.7
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SNHG16-201ENST00000448136 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10.65□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 CCDC15Q0P6D6 951 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 MYCT1Q8N699 235 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 MTUS1Q9ULD2 1270 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 MSH4O15457 936 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 SNHG28P0DPA3 235 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 NOVP48745 357 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 GPC5P78333 572 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF543Q08ER8 600 aa10.64□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 LIN52Q52LA3 116 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PCNX4Q63HM2 1172 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 SPATA24Q86W54 205 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 CRYGNQ8WXF5 182 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 AZIN2Q96A70 460 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 LZTS2Q9BRK4 669 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 STARD13Q9Y3M8 1113 aa10.64□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ALCAMQ13740 583 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 DBN1Q16643 649 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 QRICH1Q2TAL8 776 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 WASHC2DQ5SRD0 308 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 IZUMO3Q5VZ72 239 aa10.63□□□□□ -0.71
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SNHG16-201ENST00000448136 ZNF653Q96CK0 615 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 BTBD10Q9BSF8 475 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 ANO3Q9BYT9 981 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 ZWILCHQ9H900 591 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 VAV3Q9UKW4 847 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 CDH16O75309 829 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 EYA4O95677 639 aa10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SNHG16-201ENST00000448136 PARP10Q53GL7 1025 aa10.63□□□□□ -0.71
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