RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443634.1

SNRPBP1-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SNRPBP1, Length 282 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP1-201ENST00000443634 TAF12Q16514 161 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TCEAL5Q5H9L2 206 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 KRT39Q6A163 491 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 DPH6Q7L8W6 267 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 EFHBQ8N7U6 833 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 SPATA18Q8TC71 538 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 GPT2Q8TD30 523 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 HDAC7Q8WUI4 952 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 RABGGTAQ92696 567 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 SENP8Q96LD8 212 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 FAM81BQ96LP2 452 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PIDD1Q9HB75 910 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 CLDND1Q9NY35 253 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 FNIP2Q9P278 1114 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 MAFFQ9ULX9 164 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 IRAK3Q9Y616 596 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 COL4A6Q14031 1691 aa7.25□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 SIP14410 1827 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PIRO00625 290 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PRRG1O14668 218 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 FSCN2O14926 492 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 FAM189A1O60320 539 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 XYLBO75191 536 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ARHGEF15O94989 841 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 CPB1P15086 417 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 FGFR3P22607 806 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 BRCC3P46736 316 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 CASP4P49662 377 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ARPP19P56211 112 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 NCOA4Q13772 614 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZNF699Q32M78 642 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TPGS2Q68CL5 300 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 RTL10Q7L3V2 364 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 GUCD1Q96NT3 240 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 KLHL5Q96PQ7 755 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 GPR62Q9BZJ7 368 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZBP1Q9H171 429 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 THAP9Q9H5L6 903 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TMEM8AQ9HCN3 771 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 CHST7Q9NS84 486 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 HCSTQ9UBK5 93 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 SNX9Q9Y5X1 595 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 BACE2Q9Y5Z0 518 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ATP8B3O60423 1300 aa7.24□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ANO9A1A5B4 782 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 EPOPA6NHQ4 379 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 M0QZQ0 153 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PER2O15055 1255 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 P4HA2O15460 535 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 AKAP3O75969 853 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TKTP29401 623 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 OR1D2P34982 312 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ALDH1A3P47895 512 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 GCLMP48507 274 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TUFMP49411 452 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 MXI1P50539 228 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 GUCY2FP51841 1108 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PLD1Q13393 1074 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ADGRE1Q14246 886 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PTPN14Q15678 1187 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 NAB2Q15742 525 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 DUSP6Q16828 381 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 UVSSAQ2YD98 709 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 IQCEQ6IPM2 695 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 TTI2Q6NXR4 508 aa7.23□□□□□ -1.25
SNRPBP1-201ENST00000443634 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms