RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.73□□□□□ -0.37
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PRAME-210ENST00000442481 CXCL16Q9H2A7 254 aa12.7□□□□□ -0.38
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PRAME-210ENST00000442481 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PRAME-210ENST00000442481 LMAN1LQ9HAT1 526 aa12.7□□□□□ -0.38
PRAME-210ENST00000442481 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PRAME-210ENST00000442481 NOTCH4Q99466 2003 aa12.7□□□□□ -0.38
PRAME-210ENST00000442481 EDN1P05305 212 aa12.69□□□□□ -0.38
PRAME-210ENST00000442481 HARSP12081 509 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PRAME-210ENST00000442481 PLS3P13797 630 aa12.69□□□□□ -0.38
PRAME-210ENST00000442481 FCARP24071 287 aa12.69□□□□□ -0.38
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