RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC13DQ70J99 1090 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CLNKQ7Z7G1 428 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX32Q86XE0 403 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PALB2Q86YC2 1186 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SVIPQ8NHG7 77 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 EBF3Q9H4W6 596 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 NPHS2Q9NP85 383 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GINM1Q9NU53 330 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 NMT2O60551 498 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 USP1O94782 785 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CALML3P27482 149 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CHKAP35790 457 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 OXCT1P55809 520 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CALCOCO2Q13137 446 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 LLGL1Q15334 1064 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ART4Q93070 314 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF12Q96QT6 1004 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC1Q99614 292 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 MINPP1Q9UNW1 487 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 RASA4BC9J798 803 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 RASA4O43374 803 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 UCHL3P15374 230 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNA3P32297 505 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PHEXP78562 749 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC16Q13042 620 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TMED2Q15363 201 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CTC1Q2NKJ3 1217 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 NIM1KQ8IY84 436 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP61Q8NHU2 1237 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CALML4Q96GE6 196 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 AAASQ9NRG9 546 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GGA1Q9UJY5 639 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 THAP12O43422 761 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC26A4O43511 780 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP9BO43861 1147 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF862O60290 1169 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 EDF1O60869 148 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TOMM70O94826 608 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52Z1P0C646 297 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CALM1P0DP23 149 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CALM2P0DP24 149 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CALM3P0DP25 149 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 VCAM1P19320 739 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 MARCKSL1P49006 195 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS41P49754 854 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNH2Q12809 1159 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 LETM2Q2VYF4 491 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 VPS36Q86VN1 386 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 LDHDQ86WU2 507 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 MYOCDQ8IZQ8 938 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM161BQ96MY7 647 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PWWP2AQ96N64 755 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 SAR1AQ9NR31 198 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK4P11802 303 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ANPEPP15144 967 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 GNALP38405 381 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 RGS2P41220 211 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 TXKP42681 527 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGEF1-203ENST00000439720 PRELPP51888 382 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms