RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429751.6

RRN3-203, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,198 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-203ENST00000429751 MARCKSL1P49006 195 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PEX5P50542 639 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 KCNA1Q09470 495 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CALCOCO2Q13137 446 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ACVR2BQ13705 512 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 BLMHQ13867 455 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 LONRF1Q17RB8 773 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RNF43Q68DV7 783 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PALB2Q86YC2 1186 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CCDC105Q8IYK2 499 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ARMC5Q96C12 935 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SEPT4O43236 478 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RFX1P22670 979 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GPC5P78333 572 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CCDC25Q86WR0 208 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CEP120Q8N960 986 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SAAL1Q96ER3 474 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 FAM20AQ96MK3 541 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 WHRNQ9P202 907 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.66□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 NFASCO94856 1347 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MTA2O94776 668 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 EYA4O95677 639 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 INHAP05111 366 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 PYGMP11217 842 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CREB1P16220 341 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 COMTP21964 271 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MYL7Q01449 175 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CAP1Q01518 475 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 LMNB2Q03252 620 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MTMR1Q13613 665 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CBWD6Q4V339 395 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TEX9Q8N6V9 391 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 SLCO2A1Q92959 643 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 CD101Q93033 1021 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 RMDN2Q96LZ7 410 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 MAGEB18Q96M61 343 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 KATNBL1Q9H079 304 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.65□□□□□ -1.02
RRN3-203ENST00000429751 UBE4BO95155 1302 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 TCEA3O75764 348 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 UNC5CO95185 931 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ACSL3O95573 720 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ECEL1O95672 775 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 NKX3-2P78367 333 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 MGAT5Q09328 741 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 MESDQ14696 234 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 CCL14Q16627 93 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PARP6Q2NL67 630 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PRR16Q569H4 304 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa8.65□□□□□ -1.03
RRN3-203ENST00000429751 CGB2Q6NT52 195 aa8.65□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms