RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM221A6NGB7 291 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 GOLGA8JA6NMD2 632 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 M0R296 226 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 CCL16O15467 120 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 EXTL3O43909 919 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 PFKFB1P16118 471 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 TYMPP19971 482 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 AFMP43652 599 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 ASIC1P78348 528 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 SIGLEC14Q08ET2 396 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM26FQ5R3K3 315 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 TPGS2Q68CL5 300 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 BRSK2Q8IWQ3 736 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 TCEAL8Q8IYN2 117 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 SYCP3Q8IZU3 236 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 APPL2Q8NEU8 664 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 SENP8Q96LD8 212 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 SPATA32Q96LK8 384 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 DPP3Q9NY33 737 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 SORCS3Q9UPU3 1222 aa13.15□□□□□ -0.3
RPSAP46-201ENST00000428316 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ANHXE9PGG2 379 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 IL18RAPO95256 599 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CYP11A1P05108 521 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 LAMP2P13473 410 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PAX3P23760 479 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KRT85P78386 507 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 BMT2Q1RMZ1 405 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 LIN9Q5TKA1 542 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NT5DC4Q86YG4 428 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM84AQ96KN4 292 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM209Q96SK2 561 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PIDD1Q9HB75 910 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MYO10Q9HD67 2058 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 OR4Q2P0C623 313 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 FSHRP23945 695 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NDUFA8P51970 172 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ARPP19P56211 112 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 STK4Q13043 487 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MTMR3Q13615 1198 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF280DQ6N043 979 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ARMCX5Q6P1M9 558 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CBWD2Q8IUF1 395 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 UBALD2Q8IYN6 164 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GPD1LQ8N335 351 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC44A3Q8N4M1 653 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ITFG1Q8TB96 612 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 RSAD2Q8WXG1 361 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CRISPLD1Q9H336 500 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PDE11AQ9HCR9 933 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SIX4Q9UIU6 781 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 MAFFQ9ULX9 164 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 DOCK6Q96HP0 2047 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 NOTCH4Q99466 2003 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 A0A1W2PQ27 194 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 A0A1W2PQ64 194 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 A0A1W2PQD8 194 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 ADCY1Q08828 1119 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GPR17Q13304 367 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 TDGQ13569 410 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC5A9Q2M3M2 681 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 OVOS1Q6IE37 1185 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 LRRTM3Q86VH5 581 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CEP57L1Q8IYX8 460 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 OR10T2Q8NGX3 314 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 FGF13Q92913 245 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 CYP4F11Q9HBI6 524 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 IGSF9Q9P2J2 1179 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP46-201ENST00000428316 USP25Q9UHP3 1055 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms