RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 PODXLO00592 558 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SPAG7O75391 227 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 GAS8O95995 478 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 CLTAP09496 248 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MAMLD1Q13495 774 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SPRED3Q2MJR0 410 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 TIPINQ9BVW5 301 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 F5H423 210 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 RIPK2O43353 540 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 PSMD6Q15008 389 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF699Q32M78 642 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 P3H1Q32P28 736 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 PPM1EQ8WY54 764 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MAPK6Q16659 721 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 CD302Q8IX05 232 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 KAT2BQ92831 832 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 CD101Q93033 1021 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 APOL6Q9BWW8 343 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 CISHQ9NSE2 258 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.86■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SGK1O00141 431 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MAFGO15525 162 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 TMED2Q15363 201 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 UBA3Q8TBC4 463 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 VPS37BQ9H9H4 285 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 AKT3Q9Y243 479 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 VTNP04004 478 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 GCNT1Q02742 428 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 TFAP2BQ92481 460 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 HSPH1Q92598 858 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 FBXL18Q96ME1 805 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 EFCC1Q9HA90 598 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 FAM47EQ6ZV65 393 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SAYSD1Q9NPB0 183 aa20.85■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 FAM107AO95990 144 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 NAMPTP43490 491 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 NOMO3P69849 1222 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 RNF181Q9P0P0 153 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 GH1P01241 217 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 GPS1Q13098 491 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ERICH1Q86X53 443 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.84■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MNAT1P51948 309 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 KCTD2Q14681 263 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 CALN1Q9BXU9 219 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 A0A0B4J269 797 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 FZD9O00144 591 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ADCY3O60266 1144 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 PROSCO94903 275 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF286BP0CG31 522 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 BPIFB4P59827 614 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 DCLK3Q9C098 648 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.83■□□□□ 0.93
TTLL3-210ENST00000427220 RGS7P49802 495 aa20.83■□□□□ 0.92
TTLL3-210ENST00000427220 AMHR2Q16671 573 aa20.83■□□□□ 0.92
TTLL3-210ENST00000427220 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.83■□□□□ 0.92
TTLL3-210ENST00000427220 C17orf75Q9HAS0 396 aa20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms