RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 MTM1Q13496 603 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 GBX1Q14549 363 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 RAB39AQ14964 217 aa3.08□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 A6NNZ2 444 aa3.06□□□□□ -1.92
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PTPRC-208ENST00000427110 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 MAEAQ7L5Y9 396 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-208ENST00000427110 RHOT2Q8IXI1 618 aa3.06□□□□□ -1.92
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