RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 KPNA7A9QM74 516 aa18.17■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 F8VZ95 297 aa18.17■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DDHD2O94830 711 aa18.17■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 AIPL1Q9NZN9 384 aa18.16■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa18.15■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.15■□□□□ 0.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEA1Q16626 185 aa18.15■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ARID3AQ99856 593 aa18.15■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa18.15■□□□□ 0.5
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SPTLC1O15269 473 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 GJB5O95377 273 aa18.14■□□□□ 0.49
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TOP3BP1-201ENST00000420768 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM71AQ8IYT1 594 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOP6BLQ8N6T0 577 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 CISHQ9NSE2 258 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLIQ9UNA4 740 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNTN6Q9UQ52 1028 aa18.14■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCN5AQ14524 2016 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 HUS1O60921 280 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 TACC1O75410 805 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1G1P47890 313 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 HS1BP3Q53T59 392 aa18.13■□□□□ 0.49
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIMS2Q7Z4I7 341 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBR7Q8N806 425 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 APPL2Q8NEU8 664 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 YME1L1Q96TA2 773 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJB4Q9UDY4 337 aa18.13■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 LTBP2Q14767 1821 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 CYB561D2O14569 222 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 NRP1O14786 923 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAPPC3O43617 180 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 B4GALT3O60512 393 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 GFPT2O94808 682 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF4AO95239 1232 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPING1P05155 500 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 WEE2P0C1S8 567 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 KRT5P13647 590 aa18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 BPIFB4P59827 614 aa18.12■□□□□ 0.49
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