RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411292.1

SNORD71-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 71, humanhuman

BASIC

Gene SNORD71, Length 86 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD71-201ENST00000411292 GDF7Q7Z4P5 450 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SPRED1Q7Z699 444 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 GPR149Q86SP6 731 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 TTC7BQ86TV6 843 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 FAM83AQ86UY5 434 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 XYLT1Q86Y38 959 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ULK2Q8IYT8 1036 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ADGRG5Q8IZF4 528 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 D2HGDHQ8N465 521 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PDPRQ8NCN5 879 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 BEND2Q8NDZ0 799 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ZFP28Q8NHY6 868 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PPP1R35Q8TAP8 253 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CYP2W1Q8TAV3 490 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 KLHDC4Q8TBB5 520 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ASB10Q8WXI3 467 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 DPF2Q92785 391 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SCAMP4Q969E2 229 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 RFKQ969G6 155 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 RAB24Q969Q5 203 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SLC35A4Q96G79 324 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 FAM89AQ96GI7 184 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 WDYHV1Q96HA8 205 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 KAZALD1Q96I82 304 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 BOD1Q96IK1 185 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PDLIM2Q96JY6 352 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 COQ10AQ96MF6 247 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 NT5C1BQ96P26 610 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 MED15Q96RN5 788 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ADOQ96SZ5 270 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 AGAP2Q99490 1192 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 MAP3K14Q99558 947 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 MNTQ99583 582 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CGRRF1Q99675 332 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 C7orf25Q9BPX7 421 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 MRI1Q9BV20 369 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ADI1Q9BV57 179 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CNPPD1Q9BV87 410 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SARGQ9BW04 601 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 TOR3AQ9H497 397 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 RNPEPQ9H4A4 650 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ARNT2Q9HBZ2 717 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 AKIP1Q9NQ31 210 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SERHLQ9NQF3 203 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PRDM11Q9NQV5 511 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CHST12Q9NRB3 414 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 C1orf112Q9NSG2 853 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 TDP1Q9NUW8 608 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 TMEM140Q9NV12 185 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 OBP2AQ9NY56 170 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 MOCS1Q9NZB8 636 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 COL20A1Q9P218 1284 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CHPF2Q9P2E5 772 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 IP6K2Q9UHH9 426 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 USP25Q9UHP3 1055 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 INTUQ9ULD6 942 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 FAM184BQ9ULE4 1060 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SLC45A2Q9UMX9 530 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 AGAP1Q9UPQ3 857 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ZDHHC9Q9Y397 364 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 TCAF1Q9Y4C2 921 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 NR2E3Q9Y5X4 410 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa0.63□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 COL4A3Q01955 1670 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 COL15A1P39059 1388 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PIPSLA2A3N6 862 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CAPN8A6NHC0 703 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CGB1A6NKQ9 187 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ZAR1LA6NP61 321 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ADM5C9JUS6 153 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 F8W8V4 182 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 MASP2O00187 686 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 GOLIM4O00461 696 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CYR61O00622 381 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 PCDH17O14917 1159 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 ADAMTS3O15072 1205 aa0.62□□□□□ -2.31
SNORD71-201ENST00000411292 CCP110O43303 1012 aa0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms