RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390868.1

RNU1-77P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 77, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-77P, Length 162 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-77P-201ENST00000390868 LAMP2P13473 410 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 GAP43P17677 238 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 CD72P21854 359 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 RFX1P22670 979 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 RPL9P32969 192 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 CCR2P41597 374 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 GPR15P49685 360 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 CREMQ03060 361 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 DUSP4Q13115 394 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 TDGQ13569 410 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 GRM2Q14416 872 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZBTB6Q15916 424 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 SLC39A12Q504Y0 691 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 SDHAF4Q5VUM1 108 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 SPATA1Q5VX52 437 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 WSCD1Q658N2 575 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 OVOS1Q6IE37 1185 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 PLCD3Q8N3E9 789 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 FBXL6Q8N531 539 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 ATAD1Q8NBU5 361 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 PRSS33Q8NF86 280 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 TTC8Q8TAM2 541 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 GIPC2Q8TF65 315 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 FGF13Q92913 245 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 FGF14Q92915 247 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 SENP8Q96LD8 212 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 SPATA32Q96LK8 384 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 TRIM9Q9C026 710 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 DPP3Q9NY33 737 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 CEP72Q9P209 647 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 KCNG1Q9UIX4 513 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 AGAP1Q9UPQ3 857 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 EXOC7Q9UPT5 735 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU1-77P-201ENST00000390868 NCOR1O75376 2440 aa5.9□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 DOCK8Q8NF50 2099 aa5.9□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 PTPRJQ12913 1337 aa5.9□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 NOTCH4Q99466 2003 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 KRBA1A5PL33 1030 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 SYN3O14994 580 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 XPOTO43592 962 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 ADRB2P07550 413 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 DCNP07585 359 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 DLATP10515 647 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 ODC1P11926 461 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 PFKFB1P16118 471 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 AVPR2P30518 371 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 LRPAP1P30533 357 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 HOXD13P35453 343 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 PLA2G5P39877 138 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 CASP4P49662 377 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 TAF6P49848 677 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 LILRA4P59901 499 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 GPC5P78333 572 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 HTR4Q13639 388 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 TEAD2Q15562 447 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 FAM26FQ5R3K3 315 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 STXBP5Q5T5C0 1151 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 RESP18Q5W5W9 173 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 PDXDC1Q6P996 788 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 NPAS3Q8IXF0 933 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 CEP57L1Q8IYX8 460 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 GPD1LQ8N335 351 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 SLC44A3Q8N4M1 653 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 C1orf127Q8N9H9 656 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 FSIP1Q8NA03 581 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 IQUBQ8NA54 791 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 APPL2Q8NEU8 664 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 OR5B17Q8NGF7 314 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZNF461Q8TAF7 563 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 KCNG4Q8TDN1 519 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU1-77P-201ENST00000390868 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms