RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 H0Y626 953 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 BBOX1O75936 387 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TUBB4AP04350 444 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CD40P25942 277 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 LTBRP36941 435 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRR20EP86478 221 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRR20CP86479 221 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRR20DP86480 221 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRR20BP86481 221 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRR20AP86496 221 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 NOGQ13253 232 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PLCL1Q15111 1095 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 RAB30Q15771 203 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TSTQ16762 297 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PPM1JQ5JR12 505 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ACAD10Q6JQN1 1059 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ADSSL1Q8N142 457 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 NGEFQ8N5V2 710 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT11Q8NCW6 608 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 KCNC2Q96PR1 638 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 FANCD2OSQ96PS1 177 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 HDAC8Q9BY41 377 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM54Q9BYV2 358 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4F11Q9HBI6 524 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CBX8Q9HC52 389 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 GPATCH2Q9NW75 528 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 HOXC10Q9NYD6 342 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SEL1LQ9UBV2 794 aa2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS29PA6NIE9 313 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 APOL1O14791 398 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN9O14815 690 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SGTAO43765 313 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 KDM1AO60341 852 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SCGB1D1O95968 90 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 AVPP01185 164 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CYP17A1P05093 508 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 FUT4P22083 530 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 NPTX2P47972 431 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CASP6P55212 293 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 INHBEP58166 350 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MGAT2Q10469 447 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SLC14A1Q13336 389 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 POU4F3Q15319 338 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TBCCQ15814 346 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 RILPL1Q5EBL4 403 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ARMC4Q5T2S8 1044 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD5Q6N075 450 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD6Q6ZSS7 791 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 HFE2Q6ZVN8 426 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MIER2Q8N344 545 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MAML3Q96JK9 1138 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD14AQ96MC6 490 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 HEPHQ9BQS7 1158 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 BOCQ9BWV1 1114 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 STRA6Q9BX79 667 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ITPAQ9BY32 194 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PLAGL2Q9UPG8 496 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 WDFY4Q6ZS81 3184 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM43BA6NCK2 446 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 GRM6O15303 877 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CCP110O43303 1012 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SOCS5O75159 536 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 COL6A2P12110 1019 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ALAS1P13196 640 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 GRK3P35626 688 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 FHL3Q13643 280 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 KYNUQ16719 465 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CATSPER4Q7RTX7 472 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 EPHX4Q8IUS5 362 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 PPIL6Q8IXY8 311 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 MFSD2AQ8NA29 543 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 VMP1Q96GC9 406 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 RAX2Q96IS3 184 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CNPPD1Q9BV87 410 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 SUGCTQ9HAC7 445 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CLDN16Q9Y5I7 305 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 POM121BA6NF01 834 aa2.79□□□□□ -1.96
CCSAP-202ENST00000366686 XPOTO43592 962 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms